圣庭生物-ShengTingGroup

平台简介

圣庭集团拥有1台HiSeq 2500测序仪。HiSeq 2500是Illumina公司最新推出的高通量测序仪,这款新一代的测序系统将让研究人员和临床医生能够在大约24小时内完成整个基因组的测序,即“一天的基因组”。

HiSeq 2500采用稳定的可逆终止法边合成边测序技术。该技术使用4种含有末端阻断基团和不同荧光信号的碱基进行模板互补链的合成,不仅确保了测序的高精确性和高顺序性,而且排除了由重复序列和同聚物导致的测序错误。

HiSeq 2500兼备速度和灵活性,拥有两种测序模式,让研究人员能够在27小时内产生120 Gb(快速运行模式),或在11天的运行中产生600 Gb(高产量模式)。

HiSeq 2500测序涉及生物学各个领域,包括小RNA测序、转录组测序、甲基化测序、外显子捕获测序、动植物重测序,动植物从头测序等。因此,HiSeq 2500能够为基因调控分析、转录组分析、SNP位点分析、结构变异分析和疾病分析等提供迅捷、庞大、准确的信息数据为您的科学研究提供可信的保障。

性能参数

流程

从样品制备到数据分析,HiSeq系统的流程在所有NGS技术中是最快速最易用的。

1、 轻松的样品制备和富集。

        通过行业最快的流程来制备DNA或RNA样品。

2、 强大的测序灵活性。

        在快速周转时间和高产量模式之间轻松转换,以满足您的研究需求。

3、 久经考验的数据分析方案。

        通过一套完整的系统和数据分析软件,以及各种开源和商业化的工具,可从原始数据中获得有意义的结果。

平台优势

1、 前所未有的灵活性

HiSeq 2500系统是Illumina第一台特有两种运行模式的测序系统,包括快速运行和高产量运行模式,可使用一个或两个流动槽,使之成为一个灵活且可扩展的平台。快速运行模式提供快速的结果、数量有限样品的高效处理,以及更长的末端配对150 bp读取,这带来了更深度的覆盖,并改善de novo应用的组装。高产量模式特别适合样品量较多的大型研究,或需要最深度覆盖的应用。高产量模式可处理的样品量是快速模式的~5倍,让大型项目可通过尽可能少的运行来完成。

2、 惊人的速度和通量

快速运行模式是HiSeq系统设计上的一个革命性附加,它通过缩短的循环时间和内置的簇生成来显著加快运行。在快速运行模式下,您能够完成全自动的簇生成和测序,在一个工作日内实现短读取应用,或在一天多的时间内通过末端配对100 bp读取实现全基因组测序应用。数据通量超过100 Gb,因此一天内人类基因组的测序覆盖度超过30倍(图1)。在需要快速且准确的答案时,快速运行时间再加上卓越的数据质量很关键。快速运行模式的加速运行以及平行处理约6亿个测序模板的能力带来了现有测序系统中最高的每日通量。

图1:前所未有的灵活性支持多个应用

3、 出色的数据质量

高的数据质量是通过行业中最广泛采用的边合成边测序(SBS)技术的应用来确保的。HiSeq 1500/2500系统的SBS技术利用专利的可逆终止子方法对数百万个片段进行测序,在单个碱基掺入增长的DNA链时检测它们。由于每个测序循环中四种与可逆终止子结合的dNTP都存在,故自然竞争让掺入偏向最小化,与其他技术相比大大降低了原始错误率。最终结果是高度准确的base-by-base测序,几乎避免了序列背景特异的错误,即使是在那些重复序列区和同聚物中。Illumina测序带来了行业中任何覆盖水平的最准确人类基因组、最高产量的无错误读取以及最高比例的>Q30碱基检出(图2)。

图2:快速运行模式下的读取 vs. Q值

文档下载

  平台资料

cBot

cBot是新一代的Illumina测序流程改进。cBot是一种革命性的自动化系统,能够从单分子DNA模板中创建克隆簇,制备后用于HiSeq、HiScanSQ和Genome Analyzer IIx的边合成边测序。