宏基因组测序

宏基因组测序(Metagenomics Sequencing)是对环境样品中的微生物群落的基因组进行高通量测序,主要研究微生物种群结构、基因功能活性、微生物之间的相互协作关系以及微生物与环境之间的关系。宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制,扩展了微生物资源的利用空间,为环境微生物群落的研究提供了有效工具。

宏基因组测序

宏基因组测序(Metagenomics Sequencing)是对环境样品中的微生物群落的基因组进行高通量测序,主要研究微生物种群结构、基因功能活性、微生物之间的相互协作关系以及微生物与环境之间的关系。宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制,扩展了微生物资源的利用空间,为环境微生物群落的研究提供了有效工具。

技术优势

直接对特定环境中全部微生物群体基因组进行测序。环境微生物通常以群落方式共存和互作,宏基因组研究比单个个体研究更能反映微生物的真实生存状态。除分析微生物群体多样性和丰度外,还可以解析微生物基因功能和参与的代谢通路,发掘新的具有特定功能的基因。

技术路线
分析内容
样本类型
  • 环境样品,总DNA等

  • 建议总DNA起始量:5 μg,最低0.5 μg,浓度≥30 ng/μL(Qubit定量)

常规项目周期
  • 35个工作日

参考文献
  • Campbell J D, Alexandrov A, Kim J, et al. Distinct patterns of somatic genome alterations in lung adeno-carcinomas and squamous cell carcinomas[J]. Nature Genetics, 2016, 48(6):607.