面对重症感染患者，能否快速确认感染性疾病原体，成为后续对症治疗的关键。传统的微生物鉴定方法分为培养和非培养两类，临床公认的“金标准”是分离培养和生化鉴定，这种方法的操作周期长、失败率高，并且不是每种病原体都可以培养。不依赖培养的方法比如涂片镜检、抗体抗原免疫等，在采样当天即可报告结果。这些方法的时效性强，但在敏感性和特异性上存在较明显的劣势，而且传统的微生物鉴定方法对于未知或者罕见的病原微生物，无法快速识别。

而mNGS不依赖于传统的微生物培养，也无需特异性扩增，直接对临床样本中的核酸进行无差别、无选择性的高通量测序，然后与已知的微生物序列数据库进行比对分析，根据比对到的序列信息来判断样本包含的病原微生物种类，能够快速、客观地检测临床样本中的病原微生物（包括病毒、细菌、真菌、寄生虫）

目前已经有数十篇mNGS专家共识中提到，对于一些危重症感染患者，建议留取合适的标本，进行mNGS检测，更快更精准的帮助临床找到感染性疾病原体，从而精准使用抗生素。

拿到一份mNGS报告应该关注以下专业名词：

l读长：测序仪单个测序反应所得到的碱基序列。读长长度指该碱基序列的碱基数。读长数量指测序获得的碱基序列的数量。

l相对丰度：指除去宿主序列之后，某微生物物种序列在相应大类物种（通常分成细菌、真菌、病毒、寄生虫4大类）中的分布比例。丰度越高，表示该物种所占比例越高。

l检出限（limit of detection，LOD）：指检测对象可以被某特定方法可靠地检测到的最低浓度（严格意义上是达到某概率的最低检测浓度）。

l比对：指将测序的读长与参考基因组进行匹配的过程。

l检出序列数（reads）：配到该病原体的序列数目，其多少与标本中病原体本身载量负荷、核酸提取量、人源序列比例有关。序列数越高，表示标本中检测到该病原体的可信度越高。

llmNGS报告具体如何解读建议进一步询问临床医生。